Institut für
FG Forstgenetik
Projekt
Genomanalysen in Bäumen
Bäume zeigen häufig weite Verbreitungsgebiete mit großen ökologischen Amplituden. Durch strukturelle und funktionelle genomische Analysen möchten wir die zugrundeliegende adaptive genetische Variation verstehen.
Hintergrund und Zielsetzung
Bäume zeigen häufig weite Verbreitungsgebiete mit großen ökologischen Amplituden. An verschiedenen Orten ihres Verbreitungsgebiets müssen Sie also mit sehr verschiedenen Umweltbedingungen zurechtkommen. Darüber hinaus sind sie langlebig, wodurch sie im Verlauf ihres Lebens aber auch im Jahresverlauf mit verschiedensten Stressereignissen konfrontiert werden.
Um diese Herausforderungen zu bewältigen, müssen Bäume ein großes Anpassungspotential besitzen. Dafür benötigen sie sowohl ein hohes Maß an struktureller genetischer Diversität als auch die Fähigkeit plastisch zu reagieren, beispielsweise durch unterschiedliche Genexpression. Um diese Prozesse besser zu verstehen, führen wir verschiedene strukturelle und funktionelle genomische Analysen in Waldbäumen durch.
Vorläufige Ergebnisse
Der Ansatz leitet sich aus den Ergebnissen früherer Arbeiten ab. Dort wurde zum ersten Mal gezeigt, dass die gentechnische Übertragung eines Transposons (Ac aus Mais) in das Genom von Pappeln möglich ist, und dass Ac seine ursprüngliche Position im Konstrukt verlassen und sich irgendwo im Genom re-integrieren kann (Transposition). Weiterhin wurde festgestellt, dass eine Transposition von Ac in den nun sechs Jahre alten transgenen Pflanzen immer noch stattfindet.; ; Nach Transformation mit Ac wurde
Thünen-Ansprechperson
Thünen-Beteiligte
Zeitraum
Daueraufgabe 2.2000 - 2.2031
Weitere Projektdaten
Projektstatus:
läuft
Publikationen zum Projekt
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Wehenkel C, Hernández-Díaz JC, Hernández-Velasco J, Simental-Rodríguez SL, Porth I, Goessen R, González-Elizondo MS, Fladung M, Groppe K, Jaramillo-Correa JP, Olivas-García JM, Gernandt DS, Martínez-Ávalos JG, Carrillo-Parra A, Mendoza-Maya E, Sáenz-Romero C, Blanco-García A (2024) Mexican Populus tremuloides Michx: Adaptation to climate change under extreme heterozygote excess. In: Porth I, Klápšte J, McKown A (eds) The poplar genome. Cham: Springer, pp 183-190, DOI:10.1007/978-3-031-50787-8_9
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Mosca E, Cruz F, Gomez-Garrido J, Bianco L, Rellstab C, Brodbeck S, Csillery K, Fady B, Fladung M, Fussi B, Gömöry D, González-Martínez SC, Grivet D, Gut M, Hansen OK, Heer K, Kaya Z, Krutovsky KV, Kersten B, Liepelt S, et al (2019) A reference genome sequence for the European silver fir (Abies alba Mill.): A community-generated genomic resource. G3 Genes Genomes Genetics 9(7):2039-2049, DOI:10.1534/g3.119.400083
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